stage

SELECTION DE LIGNEES TRANSGENIQUES D’INTERET PAR IMAGERIE HYPERSPECTRALE

UMR0588 BioForA, INRA Postée il y a 5 ans 45075 Orléans Entre 2 et 4 mois

Présentation de l'entreprise

Mission proposée

Le peuplier est une essence d’importance économique pour la filière forestière française de par sa forte productivité. Il présente également un fort intérêt en biologie fonctionnelle grâce à la disponibilité de son génome et à la possibilité de transformation génétique permettant de comprendre la fonction des gènes in planta. Le bois de peuplier est traditionnellement valorisé en déroulage et en sciage pour la fabrication d’emballages légers et de contreplaqué. Plus récemment, il est envisagé comme une source potentielle de bioéthanol et de coproduits à haute valeur ajoutée. La valorisation du bois dépend fortement des propriétés physico-chimiques et mécaniques des parois de ses fibres, propriétés qui sont élaborées au cours de la formation du bois. Dans le cadre de différents projets, des lignées de peupliers aux propriétés chimiques et / ou mécaniques altérées ont été produites par transgénèse. La plupart de ces lignées ont déjà été caractérisées au niveau anatomique, moléculaire et biochimique à l’échelle de la tige entière. Cependant, la diversité cellulaire du bois représente un obstacle conséquent dans l’étude des mécanismes moléculaires liés à la formation du bois. Ainsi, l’étudiant sera en charge de mettre en application une technique d’imagerie hyperspectrale innovante (imagerie infra-rouge à transformée de Fourier en réflectance totale atténuée) sur vingt de ces lignées. L’étudiant aura en charge la préparation des échantillons, l’acquisition des images hyperspectrales ainsi que l’analyse multivariées. Par cette méthode, il sera en mesure d’identifier (i) le(s) type(s) cellulaire(s) impacté(s) par la transformation et (ii) les modifications engendrées sur les propriétés physico-chimiques des parois. Ces résultats, associés aux connaissances actuelles, permettront de gagner en connaissance sur les mécanismes moléculaires liés à la formation du bois.

Profil recherché et exigences du poste

Bonnes connaissances de base en biologie végétale. Des connaissances en biochimie pariétale, histologie et spectroscopie seront appréciées. Une maitrise de base du logiciel R est préférable.

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